Phần mềm là gì? Các công bố khoa học về Phần mềm

Phần mềm là tập hợp các chương trình, quy trình và tài liệu cần thiết để thực thi các nhiệm vụ trên máy tính, giữ vai trò quan trọng trong việc điều khiển phần cứng và cung cấp chức năng cho người dùng. Phần mềm được phân loại theo nhiều tiêu chí như phần mềm hệ thống (quản lý và điều khiển phần cứng), phần mềm ứng dụng (hỗ trợ công việc cụ thể), và phần mềm nhúng (trên các thiết bị điện tử). Chu trình phát triển phần mềm bao gồm phân tích yêu cầu, thiết kế, lập trình, kiểm thử, triển khai và bảo trì. Các xu hướng mới như AI, học máy, và điện toán đám mây đang thay đổi cách phần mềm được thiết kế và sử dụng.

Phần Mềm: Khái Niệm và Phân Loại

Phần mềm máy tính, hay còn gọi là software, là một tập hợp các chương trình, quy trình và tài liệu liên quan đến việc thực thi các nhiệm vụ trên máy tính. Phần mềm có vai trò quan trọng trong việc điều khiển phần cứng và cung cấp các chức năng cho người dùng cuối.

Khái Niệm Phần Mềm

Phần mềm được xây dựng từ mã nguồn và được dịch sang ngôn ngữ máy để trở thành các chương trình có thể vận hành trên máy tính. Các phần mềm giúp máy tính thực hiện các chức năng cụ thể và cải thiện trải nghiệm của người dùng bằng cách cung cấp các công cụ và ứng dụng cần thiết.

Phân Loại Phần Mềm

Phần mềm có thể được phân loại dựa trên nhiều tiêu chí khác nhau. Dưới đây là một số phân loại phổ biến:

Phần Mềm Hệ Thống

Phần mềm hệ thống là phần mềm được thiết kế để quản lý và điều khiển phần cứng máy tính. Nó bao gồm hệ điều hành, các chương trình điều khiển (driver) và các tiện ích hệ thống khác.

Phần Mềm Ứng Dụng

Phần mềm ứng dụng là phần mềm được thiết kế để giúp người dùng hoàn thành các công việc cụ thể như xử lý văn bản, đồ họa, và kế toán. Các ví dụ phổ biến bao gồm Microsoft Office, Adobe Photoshop, và QuickBooks.

Phần Mềm Nhúng

Phần mềm nhúng được sử dụng trong các thiết bị điện tử không phải là máy tính cá nhân để điều khiển chức năng của thiết bị đó. Ví dụ điển hình có thể kể đến phần mềm trong điện thoại di động, thiết bị điện tử tiêu dùng, và thiết bị y tế.

Chu trình Phát Triển Phần Mềm

Quá trình phát triển phần mềm thường bao gồm một số giai đoạn: phân tích yêu cầu, thiết kế, lập trình, kiểm thử, triển khai, và bảo trì. Quản lý chu trình phát triển phần mềm là rất quan trọng để đảm bảo chất lượng và tiến độ của dự án.

Tương Lai của Phần Mềm

Với sự phát triển không ngừng của công nghệ, các xu hướng mới như trí tuệ nhân tạo, học máy, và điện toán đám mây đang dần thay đổi cách phần mềm được thiết kế và sử dụng. Những xu hướng này hứa hẹn mang lại những cơ hội và thách thức mới cho ngành công nghiệp phần mềm.

Danh sách công bố khoa học về chủ đề "phần mềm":

MEGA7: Phân Tích Di Truyền Phân Tử Phiên Bản 7.0 cho Dữ Liệu Lớn Hơn Dịch bởi AI
Molecular Biology and Evolution - Tập 33 Số 7 - Trang 1870-1874 - 2016
Tóm tắt Chúng tôi giới thiệu phiên bản mới nhất của phần mềm Phân Tích Di Truyền Phân Tử (MEGA), bao gồm nhiều phương pháp và công cụ tinh vi cho phân loại gen và y học phân loại. Trong lần nâng cấp lớn này, MEGA đã được tối ưu hóa để sử dụng trên các hệ thống máy tính 64-bit nhằm phân tích các tập dữ liệu lớn hơn. Các nhà nghiên cứu giờ đây có thể khám phá và phân tích hàng chục nghìn chuỗi trong MEGA. Phiên bản mới cũng cung cấp một trình hướng dẫn nâng cao để xây dựng cây thời gian và bao gồm chức năng mới để tự động dự đoán các sự kiện sao chép gen trong các cây họ gen. MEGA 64-bit được cung cấp qua hai giao diện: đồ họa và dòng lệnh. Giao diện người dùng đồ họa (GUI) là một ứng dụng dành cho Microsoft Windows có thể sử dụng cả trên Mac OS X. Dòng lệnh MEGA có sẵn dưới dạng ứng dụng gốc cho Windows, Linux và Mac OS X. Chúng được thiết kế để sử dụng trong phân tích quy mô lớn và phân tích kịch bản. Cả hai phiên bản đều được cung cấp miễn phí từ www.megasoftware.net.
#MEGA #phân tích di truyền #phân loại gen #y học phân loại #dữ liệu lớn #phần mềm khoa học
Đặc điểm và sự phát triển của Coot Dịch bởi AI
International Union of Crystallography (IUCr) - Tập 66 Số 4 - Trang 486-501 - 2010
Coot là một ứng dụng đồ họa phân tử chuyên dùng cho việc xây dựng và thẩm định mô hình phân tử sinh học vĩ mô. Chương trình hiển thị các bản đồ mật độ điện tử và các mô hình nguyên tử, đồng thời cho phép thực hiện các thao tác mô hình như chuẩn hóa, tinh chỉnh không gian thực, xoay/chuyển tay chân, hiệu chỉnh khối cố định, tìm kiếm phối tử, hydrat hóa, đột biến, phối hợp và chuẩn hóa Ramachandran. Hơn nữa, các công cụ cũng được cung cấp để thẩm định mô hình cũng như giao diện với các chương trình bên ngoài để tinh chỉnh, thẩm định và đồ họa. Phần mềm được thiết kế để dễ dàng học hỏi cho người dùng mới, nhờ vào việc đảm bảo rằng các công cụ cho những tác vụ thông thường có thể được phát hiện thông qua các thành phần giao diện người dùng quen thuộc (menu và thanh công cụ) hoặc bởi hành vi trực quan (điều khiển bằng chuột). Những phát triển gần đây đã tập trung vào việc cung cấp các công cụ cho người dùng chuyên nghiệp, với các phím tắt có thể tùy chỉnh, mở rộng và một giao diện kịch bản phong phú. Phần mềm đang trong giai đoạn phát triển nhanh chóng, nhưng đã đã đạt được sự phổ biến rộng rãi trong cộng đồng tinh thể học. Tình trạng hiện tại của phần mềm được trình bày, cùng với mô tả các tiện ích có sẵn và một số phương pháp cơ bản được sử dụng.
#Coot #đồ họa phân tử #thẩm định mô hình #mật độ điện tử #tinh chỉnh không gian thực #công cụ thẩm định #giao diện trực quan #phát triển phần mềm #cộng đồng tinh thể học.
Phát hiện số cụm cá thể bằng phần mềm structure: một nghiên cứu mô phỏng Dịch bởi AI
Molecular Ecology - Tập 14 Số 8 - Trang 2611-2620 - 2005
Tóm tắtViệc xác định các nhóm cá thể đồng nhất về di truyền là một vấn đề lâu dài trong di truyền học quần thể. Một thuật toán Bayesian gần đây được triển khai trong phần mềm structure cho phép phát hiện các nhóm như vậy. Tuy nhiên, khả năng của thuật toán này để xác định số lượng cụm thực sự (K) trong một mẫu cá thể khi các mô hình phân tán giữa các quần thể không đồng nhất chưa được kiểm tra. Mục tiêu của nghiên cứu này là thực hiện các bài kiểm tra như vậy, sử dụng các kịch bản phân tán khác nhau từ dữ liệu được tạo ra với mô hình dựa trên cá thể. Chúng tôi nhận thấy rằng trong hầu hết các trường hợp, ‘xác suất đăng nhập của dữ liệu’ ước tính không cung cấp một ước tính chính xác về số cụm, K. Tuy nhiên, sử dụng thống kê phụ thuộc ΔK dựa trên tốc độ thay đổi trong xác suất đăng nhập của dữ liệu giữa các giá trị K liên tiếp, chúng tôi phát hiện ra rằng structure chính xác phát hiện cấp độ phân cấp cao nhất trong các kịch bản mà chúng tôi đã kiểm tra. Như mong đợi, kết quả rất nhạy cảm với loại dấu hiệu di truyền được sử dụng (AFLP vs. microsatellite), số lượng locus được đánh giá, số lượng quần thể được lấy mẫu, và số lượng cá thể được xác định trong mỗi mẫu.
#genetically homogeneous groups #Bayesian algorithm #population genetics #structure software #simulation study #dispersal scenarios #hierarchical structure #genetic markers #AFLP #microsatellite #population samples
Giới thiệu mothur: Phần mềm mã nguồn mở, độc lập với nền tảng, được cộng đồng hỗ trợ để mô tả và so sánh các cộng đồng vi sinh vật Dịch bởi AI
Applied and Environmental Microbiology - Tập 75 Số 23 - Trang 7537-7541 - 2009
TÓM TẮT mothur nhắm đến mục tiêu trở thành một gói phần mềm toàn diện cho phép người dùng sử dụng một phần mềm duy nhất để phân tích dữ liệu chuỗi cộng đồng. Phần mềm này xây dựng dựa trên các công cụ trước đó để cung cấp một gói phần mềm linh hoạt và mạnh mẽ cho việc phân tích dữ liệu giải trình tự. Như một nghiên cứu điển hình, chúng tôi đã sử dụng mothur để cắt, sàng lọc và căn chỉnh các chuỗi; tính toán khoảng cách; gán các chuỗi vào các đơn vị phân loại hoạt động; và mô tả sự đa dạng α và β của tám mẫu biển trước đây được xác định bằng cách giải trình tự pyrosequencing các đoạn gen 16S rRNA. Phân tích hơn 222.000 chuỗi này đã được hoàn thành trong chưa đầy 2 giờ với một máy tính xách tay.
Phaser phần mềm tinh thể học Dịch bởi AI
Journal of Applied Crystallography - Tập 40 Số 4 - Trang 658-674 - 2007
Phaser là một chương trình để xác định cấu trúc tinh thể đại phân tử bằng cả phương pháp thay thế phân tử và phương pháp xác định thử nghiệm. Các thuật toán xác định mới được triển khai trongPhaser đã được phát triển bằng cách sử dụng tối đa xác suất và thống kê đa biến. Đối với việc thay thế phân tử, các thuật toán mới đã chứng tỏ là tốt hơn đáng kể so với các phương pháp truyền thống trong việc phân biệt các giải pháp đúng khỏi nhiễu, và đối với xác định thử nghiệm phân tán dị thường đơn sóng, các thuật toán mới, tính đến các tương quan giữaF+F, cung cấp các pha tốt hơn (sai số pha trung bình thấp hơn so với các pha được cung cấp bởi cấu trúc đã được tinh chỉnh) so với những phương pháp sử dụng giá trị trung bìnhF và sự khác biệt dị thường ΔF. Một trong những khái niệm thiết kế củaPhaser là nó có khả năng tự động hóa cao. Để đạt được điều này,Phaser (được viết bằng C++) có thể được gọi trực tiếp từ Python, mặc dù nó cũng có thể được gọi bằng cách sử dụng đầu vào theo kiểu từ khóa truyền thống củaCCP4. Phaser là một nền tảng cho sự phát triển trong tương lai của các phương pháp xác định cải tiến và việc phát hành chúng, bao gồm mã nguồn, đến cộng đồng tinh thể học.
Phần mềm khai thác dữ liệu WEKA Dịch bởi AI
Association for Computing Machinery (ACM) - Tập 11 Số 1 - Trang 10-18 - 2009
Đã hơn mười hai năm trôi qua kể từ khi WEKA được phát hành công khai lần đầu tiên. Trong thời gian đó, phần mềm đã được viết lại hoàn toàn từ đầu, phát triển mạnh mẽ và hiện nay đi kèm với một tài liệu về khai thác dữ liệu [35]. Hiện tại, WEKA được chấp nhận rộng rãi trong cả lĩnh vực học thuật và kinh doanh, có một cộng đồng năng động, và đã được tải xuống hơn 1.4 triệu lần kể từ khi được đưa lên Source-Forge vào tháng 4 năm 2000. Bài báo này cung cấp một cái nhìn tổng quan về WEKA workbench, xem xét lịch sử của dự án, và, dựa trên phiên bản ổn định 3.6 gần đây, tóm tắt những gì đã được bổ sung kể từ phiên bản ổn định cuối cùng (Weka 3.4) được phát hành vào năm 2003.
GenAlEx 6.5: phân tích gen trong Excel. Phần mềm di truyền quần thể cho giảng dạy và nghiên cứu - một bản cập nhật Dịch bởi AI
Bioinformatics (Oxford, England) - Tập 28 Số 19 - Trang 2537-2539 - 2012
Tóm tắt Tóm tắt: GenAlEx: Phân tích di truyền trong Excel là một gói phần mềm đa nền tảng cho các phân tích di truyền quần thể chạy trong Microsoft Excel. GenAlEx cung cấp phân tích các loci gen diploid đồng trội, haploid và nhị phân cùng với các chuỗi DNA. Cả phân tích dựa trên tần suất (F-statistics, độ đa dạng dị hợp tử, HWE, phân loại quần thể, mối quan hệ) và phân tích dựa trên khoảng cách (AMOVA, PCoA, kiểm định Mantel, phân tích tự tương quan không gian đa biến) đều được cung cấp. Các tính năng mới bao gồm tính toán các ước lượng mới về cấu trúc quần thể: G′ST, G′′ST, Jost’s Dest và F′ST qua AMOVA, phân tích thông tin Shannon, phân tích sự cân bằng liên kết cho dữ liệu biallelic và các kiểm định không đồng nhất mới cho phân tích tự tương quan không gian. Hỗ trợ xuất ra hơn 30 định dạng dữ liệu khác nhau. Các bài giảng giảng dạy và tùy chọn xuất kết quả mở rộng từng bước cũng được bao gồm. Hướng dẫn toàn diện đã được sửa đổi hoàn toàn. Sự sẵn có và triển khai: GenAlEx được viết bằng VBA và được cung cấp dưới dạng tiện ích bổ sung cho Microsoft Excel (tương thích với Excel 2003, 2007, 2010 trên PC; Excel 2004, 2011 trên Macintosh). GenAlEx, tài liệu hỗ trợ và các bài giảng giảng dạy có sẵn miễn phí tại: http://biology.anu.edu.au/GenAlEx. Liên hệ: [email protected]
microchecker: phần mềm nhận diện và sửa lỗi kiểu hình gen trong dữ liệu microsatellite Dịch bởi AI
Wiley - Tập 4 Số 3 - Trang 535-538 - 2004
Tóm tắtPhân hủy DNA, nồng độ DNA thấp và đột biến vị trí mồi có thể dẫn đến việc phân công sai kiểu hình gen microsatellite, gây sai lệch cho các phân tích di truyền học quần thể. microchecker là phần mềm dựa trên giao diện windows® để kiểm tra kiểu hình gen của microsatellite từ các quần thể lưỡng bội. Chương trình hỗ trợ nhận diện lỗi kiểu hình gen do các allele không khuếch đại (allele ẩn), hiện tượng ưu thế allele ngắn (rơi allele lớn), và việc ghi nhận các đỉnh kẻ. Chương trình cũng phát hiện lỗi đánh máy. microchecker ước tính tần số của allele ẩn và quan trọng hơn, có thể điều chỉnh tần số allele và kiểu hình gen của các allele đã được khuếch đại, cho phép sử dụng chúng trong các phân tích di truyền học quần thể tiếp theo. microchecker có thể được tải về miễn phí từ http://www.microchecker.hull.ac.uk/.
#Genotyping errors #Microsatellite data #DNA degradation #Population genetics #Null alleles #Large allele dropout #Stutter peaks #Microchecker #Genetic analysis tools
WSXM: Phần mềm cho viển thám hiển vi và công cụ cho công nghệ nano Dịch bởi AI
Review of Scientific Instruments - Tập 78 Số 1 - 2007
Trong công trình này, chúng tôi mô tả ngắn gọn những đặc điểm nổi bật nhất của WSXM, một phần mềm miễn phí cho viển thám hiển vi dựa trên hệ điều hành MS-Windows. Bài báo được cấu trúc thành ba phần khác nhau: Phần giới thiệu là một cái nhìn tổng quan về tầm quan trọng của phần mềm trong viển thám hiển vi. Phần thứ hai được dành riêng để mô tả cấu trúc tổng quát của ứng dụng; trong phần này, những khả năng của WSXM để đọc các tệp bên thứ ba được nhấn mạnh. Cuối cùng, một cuộc thảo luận chi tiết về một số quy trình quan trọng của phần mềm được thực hiện.
QuPath: Phần mềm mã nguồn mở cho phân tích hình ảnh bệnh học kỹ thuật số Dịch bởi AI
Scientific Reports - Tập 7 Số 1
Tóm tắtQuPath là phần mềm phân tích hình ảnh sinh học mới được thiết kế để đáp ứng nhu cầu ngày càng tăng về một giải pháp mã nguồn mở, thân thiện với người dùng và có thể mở rộng cho bệnh học kỹ thuật số và phân tích hình ảnh toàn bộ lát cắt. Ngoài việc cung cấp một bộ công cụ toàn diện cho việc xác định khối u và đánh giá sinh dấu ở quy mô lớn, QuPath còn cung cấp cho các nhà nghiên cứu tính năng xử lý hàng loạt mạnh mẽ và chức năng kịch bản, cùng với một nền tảng có thể mở rộng để phát triển và chia sẻ các thuật toán mới nhằm phân tích hình ảnh mô phức tạp. Hơn nữa, thiết kế linh hoạt của QuPath làm cho nó trở thành một công cụ phù hợp cho một loạt các ứng dụng phân tích hình ảnh bổ sung trong nghiên cứu y sinh.
Tổng số: 1,121   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 10